• iPhoneの電源を入れなおす
• iPhone側でアプリを買ってみる
• PC側iTunesでサインアウト，サインインしてからiPhoneを同期しなおす
• iPhoneの「復元」を行い、バックアップからデータを戻す

をやってみたけど直らず、

• iPhoneの「復元」を行い、「新しいiPhoneとして設定」する

で、復旧した。

ただしアプリ大きさや総量に関連がありそうとの情報も考慮し、その際

• iTunes側の設定では、iPhoneと自動的に同期をとらない設定にしておく。
• アプリのインストールは1本ずつ行う

も行ったので、実際何が効力があったか不明。

C Net Japanの記事「iPhoneアプリのクラッシュ問題、解決は9月の可能性」が、この問題を指しているのなら、来月には解決できるのかも。

ところが、MacにつないでiTunes側からiPhoneの中を表示させて見ると、こちらでは音楽データがあることになっています。
「概要」タブで表示される保存状況のステータスもそのようになっています。

iPhone自体で情報を見ると、曲とビデオが0になっていますので、iTunes側での認識とiPhone側の認識に齟齬が発生していますね。

他に事例はないかと検索してみたら、メシアブログ：iPhone 3Gの音楽データが全部消えた！で、同様のトラブルに見舞われている人を発見。
やはり、他にも発生しているようで、まだ解決されていないようです。
とりあえず、今晩にでも「復元」をかけてみることにしましょう。2.0.1で。

追記
2ちゃんにもスレが立ってた。
現状完全な、解決策がないっポイ。
さてどうしたものか